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沈陽生態板的應用原理及碳源構成

發布日期:2014-08-13 10:19 來源:http://m.ckdesk.net 點擊:

沈陽生態板在過去大量的研究中,SCU方法多是利用革蘭 氏陰性板(Gram—negative plates,簡稱 GN 板),該 板由95種碳源組成,最早設計主要是用于細菌的鑒 定[1]。之后,為了研究的需要,設計了生態板(Ecology plates,簡稱ECO板),ECO板有31種碳源,其 中的6種碳源在GN板中沒有,至少有9種是根系 分泌物的組分,ECO板相對于GN板利用了更多生 態有關的化合物,更適合于土壤微生物群落功能多 樣性研究,并且由于節省了碳源,每塊板可以同時完 成3個重復,降低了使用成本。
2 Biolog生態板研究環境微生物群落
2.1微生物代謝中的氧化一還原反應
新陳代謝簡稱代謝,是生物體表現其生命活動 的重要特征之一。代謝包括數以千計的不同酶的催 化反應,這些復雜的酶促進有機反應的實現,多是經 過反應部位的接近和取向的效應,形成過渡態而發 生的。氧化一還原反應是生物代謝過程中的一類重 要反應,其實質是電子的得失,電子從電子供體傳遞 給電子受體。當代謝物被氧化,兩個電子通常同時 傳遞,并伴隨著底物兩個質子(H+)的釋放。底物 的氧化作用亦稱作脫氫反應,其形式上等同于兩個 氫質子的釋放⑴。列舉一反應式說明其過程:
R + H+.
此反應中一個氫質子及一對電子從底物傳遞至
吡啶環,另一個氫成為溶液中的質子。
2.2四唑紫染料顯色反應
四唑染色測定法于1942年由德國萊康(H. La-kon)教授發明,其原理是根據四唑鹽類由原初氧化 態轉變為還原態時呈現明顯的顏色(粉紅色,紫色, 紅色,藍紫色和藍色)變化,來直接檢測生化代謝活 性。 
氯化3—(1—萘基)一2,5 —二苯基一2H—四 挫鎗(Tetrazolium violet,四挫紫)是一種常用的四 唑鹽,在氧化一還原反應發生的基質脫氫(包括脫電 子)生化反應過程中,四唑紫能夠優先得到電子顯示 紫色,得電子越多,紫顏色越深。細菌代謝所需的能 量主要是從生物氧化作用獲得,生物學底物在生物 體內氧化分解的過程,主要以脫氫和失電子的方式 進行。因此,應用四唑鹽顯色法可以用來評價細菌 的代謝活力。細菌利用碳源的能力越大,則紫色越 深。四唑紫顯色反應過程如下:
2.3 Biolog生態板的應用原理 
ECO板上有96個微孔,每32個孔為1個重 復,每板共計3個重復。32個微孔中除對照孔外各 個孔內都含有一種不同的有機碳源和相同含量的四 唑紫染料。將微孔內的有機碳源作為微生物的唯一 能量來源,微生物接種到微孔板上的孔中后,若能利 
用碳源,即能夠對其進行生物氧化,有電子轉移,四 唑紫就能優先俘獲電子而變成紫色。顏色的深淺反 映了微生物對相應碳源的利用能力。通過Biolog 系統的微平板讀數器,測定ECO板在590nm波長 下的光密度值(OD值),完成數據的采集與存儲。 運用主成分分析(PCA)或相似類型的多變量統計分 析方法展示不同微生物群落產生的代謝特征指紋 (Metabolic Profiles) ?其理論依據是Biolog代謝類 型的變化與群落組成的變化相關⑴。 
3 Biolog生態板碳源分類與性質 
利用Biolog方法對不同研究對象進行測定時, 產生的數據量非常大,為了充分挖掘隱含在實驗數 據中的信息,闡明不同微生物群落對不同碳源的利
用差異,首先需要弄清ECO板的碳源結構,對微平 板內31種有機碳源進行分類,為后續統計分析、解 釋實驗結果作參考。 
結合有機化合物化學官能團、微生物生理代謝 途徑和生態功能3個方面,將ECO板的31種碳源 底物分為6大類⑴:糖類及其衍生物,羧酸,氨基酸, 多聚物,酚酸類和胺類(表1)。 
3.1糖類及其衍生物
從化學結構講,糖類化合物是多羥基的醛或酮。 以多聚物形式存在的葡萄糖和其他糖類不僅是自然 界礦化過程的主要物質,而且它們也以單體的形式 存在,是大多數異養微生物重要的有機營養物。在 ECO板中,將12種有機碳源歸屬于糖類及其衍生 物中,并對其進行細化分類為7類。
表1 ECO板六類碳源
碳水化合物 氨堪酸 羧酸 多聚物 酚酸類 胺類
D—半乳糖酸—■/—內酯 D—木糖 L一天冬酰胺酸 Y—羥基丁酸 ?—環式糊精 2—羥基笨甲酸 苯乙胺
P—甲基D—葡萄糖苷 D —甘露醇 L 一苯基丙氧酸 衣康酸 肝糖 4_羥基苯甲酸 腐胺
D—纖維二糖 N—乙酰基一【)一葡萄胺 L—精氨酸 酮酸 吐溫40 
—乳糖 D?L——磷酸片油 L_蘇氨酸 D —蘋果酸 吐溫80 
I 一赤蘚糖醇 D_半乳糖醛酸 L_絲氨酸 丙酮酸甲脂 
葡萄糖~1磷酸 D—葡萄胺酸 甘氨酰谷氨酸沈陽生態板 
沈陽生態板

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